Per poter richiamare delle logiche lato server da jscript di una pagina del crm si può fare nel modo seguente:

1 - Creare una pagina .aspx da mettere sotto la root del crm.

2 - Inserire nel jscript questo codice che richiama la pagina dove ho messo la logica per recuperare i dati:

    var oXml = new ActiveXObject("Microsoft.XMLDOM");

    oXml.async = false;    <----Gli dico che la chiamata è sincrona e devo aspettare finchè non ho finito.
  
    var url = "/Custom/GetResponse.aspx?EntityTypeName=" + entityTypeName + "&EntityId=" + entityId;   <---Costruisco la querystring con i parametri che mi servono.

    oXml.load(url);   <----Lato server costruisco un xml da ritornare con i dati che mi servono*.

    var node = oXml.selectSingleNode("/result/count");   <----Mi prendo le informazioni che devo utilizzare.



* Per costruire l'xml e ritornarlo posso fare una funzione del genere da mettere nel Page_Load:

      string xmlNode = "<{0}>{1}</{0}>";
      StringBuilder sb = new StringBuilder("<result>");
     
      sb.Append(string.Format(xmlNode, "count", count.ToString()));

      sb.Append("</result>");
      Response.Write(sb.ToString());