Prendo come punto di partenza un post lasciato da Giovanni in cui lamentava delle difficoltà avute nell'installazione di Visual Studio .NET 2005 Beta 2.
http://blogs.dotnethell.it/gvnn/Post_2.aspx

C'è da dire che installare le versioni Beta è sempre un gran casino. Spesso si consiglia infatti di dare una piallata (formattata) alla macchina e reinstallare l'ambiente da capo. Chi non ha disposizione tutti questi mezzi può eventualmente fare le installazioni su macchine virtuali in modo da creare meno danni.

Per quanto riguarda la Beta 2 di Visual Studio Microsoft ha pubblicato delle Guidelines da seguire per installare la Beta 2 ripulendo il sistema da eventuali Beta precedenti (vedi Beta1). Il documento è raggiungibile da qui:
http://lab.msdn.microsoft.com/vs2005/get/vsbeta2installissues/default.aspx

E' possibile inoltre scaricare un Tool per effettuare il clean-up della macchina. Il link è presente anche nel documento qui sopra, ma per comodità lo riporto:
Microsoft Beta Cleanup Tool